Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm21394-202ENSMUST00000189463 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21779-201ENSMUST00000189508 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21745-201ENSMUST00000189513 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm20853-201ENSMUST00000189591 693 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm20895-201ENSMUST00000189601 693 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21380-201ENSMUST00000189621 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm29024-201ENSMUST00000189624 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm29249-201ENSMUST00000189647 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21184-201ENSMUST00000189684 693 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21387-201ENSMUST00000189705 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21281-201ENSMUST00000189900 693 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21247-201ENSMUST00000189954 693 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Col5a3Q9JLI2 Gm21787-201ENSMUST00000189993 693 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21658-201ENSMUST00000190025 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21804-201ENSMUST00000190072 693 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm20868-201ENSMUST00000190110 693 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21573-201ENSMUST00000190112 691 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Col5a3Q9JLI2 Gm20841-201ENSMUST00000190209 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21918-201ENSMUST00000190310 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm29279-201ENSMUST00000190324 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm20806-202ENSMUST00000190349 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm20934-201ENSMUST00000190359 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21868-202ENSMUST00000190370 694 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21805-201ENSMUST00000190371 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm20818-201ENSMUST00000190372 693 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21740-201ENSMUST00000190382 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21155-201ENSMUST00000190460 693 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21245-201ENSMUST00000190467 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21242-201ENSMUST00000190489 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21530-201ENSMUST00000190506 694 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm20904-201ENSMUST00000190518 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21802-201ENSMUST00000190593 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21799-201ENSMUST00000190662 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21835-201ENSMUST00000190671 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21851-201ENSMUST00000190752 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm20892-201ENSMUST00000190755 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21634-201ENSMUST00000190775 694 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Col5a3Q9JLI2 Gm21201-201ENSMUST00000190814 693 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Col5a3Q9JLI2 Gm21838-201ENSMUST00000190955 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm29267-201ENSMUST00000191020 378 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Col5a3Q9JLI2 Gm20798-201ENSMUST00000191050 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm28107-201ENSMUST00000191118 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21875-201ENSMUST00000191195 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21285-201ENSMUST00000191214 693 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21908-201ENSMUST00000191224 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21924-201ENSMUST00000191308 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm28459-201ENSMUST00000191319 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21316-201ENSMUST00000191348 693 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Col5a3Q9JLI2 Gm21790-201ENSMUST00000191392 693 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm20808-201ENSMUST00000191433 693 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21114-201ENSMUST00000191466 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21872-201ENSMUST00000191488 678 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Col5a3Q9JLI2 Gm21774-201ENSMUST00000191592 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21076-201ENSMUST00000191597 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21672-201ENSMUST00000191609 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21791-201ENSMUST00000191631 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Col5a3Q9JLI2 Gm21845-201ENSMUST00000191848 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Col5a3Q9JLI2 Gm38016-201ENSMUST00000194806 693 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21763-201ENSMUST00000195140 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21890-201ENSMUST00000195190 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21350-201ENSMUST00000195678 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Crip1-206ENSMUST00000200553 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm6378-201ENSMUST00000084199 444 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 AC134898.1-201ENSMUST00000223738 1836 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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