Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Baz2a-203ENSMUST00000217851 8385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Hcfc1-201ENSMUST00000033761 8138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Ldlr-201ENSMUST00000034713 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Tyw3-201ENSMUST00000052774 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Itga10-201ENSMUST00000029744 5044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pole3Q9JKP7 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms