Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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