Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm19409-201ENSMUST00000198244 2858 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 9230112E08Rik-202ENSMUST00000189441 3352 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm37813-201ENSMUST00000195003 3695 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Olfr169-204ENSMUST00000216070 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Sycp2l-201ENSMUST00000124093 2641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm30373-201ENSMUST00000215774 3500 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Slc27a6-201ENSMUST00000025500 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 D130017N08Rik-202ENSMUST00000180951 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Bcl2l11-202ENSMUST00000089634 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm37367-201ENSMUST00000191771 2602 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm39244-201ENSMUST00000209663 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Btk-202ENSMUST00000113213 2121 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Sgk2-202ENSMUST00000117123 3034 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm26751-201ENSMUST00000181218 4245 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 4933407K13Rik-203ENSMUST00000138943 4364 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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