Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Vma21-201ENSMUST00000114575 4290 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms