Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Actn2-203ENSMUST00000168193 2920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Mthfd1-206ENSMUST00000220046 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 3632454L22Rik-202ENSMUST00000153610 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm37671-201ENSMUST00000193198 2096 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Tmem255a-201ENSMUST00000066498 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Myrf-205ENSMUST00000189897 3339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Hsp90aa1-202ENSMUST00000094361 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 C230057M02Rik-201ENSMUST00000212334 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 2810029C07Rik-201ENSMUST00000180698 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm26772-201ENSMUST00000180466 3429 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Pabpc5-201ENSMUST00000040961 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm38413-202ENSMUST00000198449 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms