Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Igsf5-201ENSMUST00000000163 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Gm14853-201ENSMUST00000116081 549 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Gm15032-201ENSMUST00000118547 411 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Gm6967-201ENSMUST00000182599 1007 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Zfp572-201ENSMUST00000183674 1098 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Gm46329-201ENSMUST00000218373 609 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Cd247-202ENSMUST00000027849 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 C8b-202ENSMUST00000065072 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Gm13547-202ENSMUST00000113810 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Gm40153-201ENSMUST00000197904 637 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Gm30652-201ENSMUST00000199103 430 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Cxcl3-201ENSMUST00000031326 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Gm4883-201ENSMUST00000085702 528 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Hat1-201ENSMUST00000028408 1576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Ttc23-203ENSMUST00000107471 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Gm5046-201ENSMUST00000100608 611 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Gm24161-201ENSMUST00000104592 130 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Gm2328-201ENSMUST00000193525 535 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Mtbp-201ENSMUST00000022998 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rims1Q99NE5 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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