Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Fam83c-201ENSMUST00000029143 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Phka2-204ENSMUST00000112380 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Arid5a-202ENSMUST00000115029 4329 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Slc18a2-201ENSMUST00000026084 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed9Q99KF1 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Gm15482-201ENSMUST00000152691 4529 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Fgd4-204ENSMUST00000161188 2214 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Sncaip-203ENSMUST00000163742 3272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Dido1-205ENSMUST00000103056 4281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Tulp4-209ENSMUST00000149756 8784 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Tcaf1-201ENSMUST00000045054 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed9Q99KF1 Gtf2i-223ENSMUST00000174513 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms