Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
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