Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 AC122293.1-201ENSMUST00000218333 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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