Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Pramef8Q8CE24 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Pramef8Q8CE24 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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