Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Dsg1bQ7TSF1 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Dsg1bQ7TSF1 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Dsg1bQ7TSF1 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Dsg1bQ7TSF1 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Dsg1bQ7TSF1 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Dsg1bQ7TSF1 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Dsg1bQ7TSF1 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Dsg1bQ7TSF1 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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