Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm15383-201ENSMUST00000121889 1443 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Arg2-201ENSMUST00000021550 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm6970-201ENSMUST00000169692 666 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Mir6360-201ENSMUST00000184278 126 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm7924-201ENSMUST00000203975 785 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 AC116797.2-203ENSMUST00000225290 565 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 AC158122.1-201ENSMUST00000227398 673 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 3110009E18Rik-201ENSMUST00000027637 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm5507-201ENSMUST00000091897 1008 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Olfr281-201ENSMUST00000109163 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Apoo-201ENSMUST00000113895 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm13197-201ENSMUST00000117204 225 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm7138-201ENSMUST00000167669 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm17764-201ENSMUST00000185925 391 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Spin3-ps-201ENSMUST00000192825 770 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
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Ccdc18Q640L5 Gm44658-201ENSMUST00000207965 637 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm18119-201ENSMUST00000219972 616 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 AC165249.1-203ENSMUST00000219976 392 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm44907-201ENSMUST00000207423 1633 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Igkv3-9-201ENSMUST00000103398 359 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Hsd17b13-203ENSMUST00000120320 1118 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm9075-201ENSMUST00000168738 794 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm26913-201ENSMUST00000182391 732 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
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Ccdc18Q640L5 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Ccdc18Q640L5 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Ccdc18Q640L5 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm16214-201ENSMUST00000143710 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm3532-201ENSMUST00000181880 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 St6galnac2-206ENSMUST00000144398 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm12961-201ENSMUST00000120507 1050 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Il24-201ENSMUST00000121040 1159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm12679-201ENSMUST00000123899 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm16131-201ENSMUST00000131007 659 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm15208-201ENSMUST00000134448 493 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Elof1-201ENSMUST00000013966 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm27383-201ENSMUST00000184418 361 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm44700-201ENSMUST00000208228 846 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Pln-205ENSMUST00000219921 531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm7664-201ENSMUST00000221988 745 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm8256-202ENSMUST00000227964 828 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Fibp-201ENSMUST00000025847 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Crip1-201ENSMUST00000006523 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Vmn1r199-201ENSMUST00000091732 1104 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm5910-201ENSMUST00000211819 1746 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc18Q640L5 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms