Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rnf123Q5XPI3 Ccdc87-201ENSMUST00000088653 3163 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rnf123Q5XPI3 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rnf123Q5XPI3 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rnf123Q5XPI3 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rnf123Q5XPI3 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rnf123Q5XPI3 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rnf123Q5XPI3 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rnf123Q5XPI3 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rnf123Q5XPI3 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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Rnf123Q5XPI3 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Rnf123Q5XPI3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf123Q5XPI3 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms