Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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