Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 A630009H07Rik-201ENSMUST00000208485 2159 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Colq-205ENSMUST00000150054 2867 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Stat6-201ENSMUST00000092074 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 4933414I15Rik-201ENSMUST00000109123 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm42488-201ENSMUST00000197648 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Tbc1d24-202ENSMUST00000040474 6269 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Kirrel3-205ENSMUST00000187182 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm37798-201ENSMUST00000193026 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Rest-201ENSMUST00000080359 7004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Pml-201ENSMUST00000085673 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Vmn2r-ps97-201ENSMUST00000222427 1970 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm37633-201ENSMUST00000192858 2700 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gpatch8-206ENSMUST00000143842 6871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 B230323A14Rik-201ENSMUST00000180488 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Rimbp2-201ENSMUST00000111346 4264 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Pik3c3-201ENSMUST00000091978 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Ldlr-201ENSMUST00000034713 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Sulf2-202ENSMUST00000109249 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Olfr433-201ENSMUST00000052975 2406 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Micall2-204ENSMUST00000170773 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Tbcel-203ENSMUST00000125995 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Tacr1-202ENSMUST00000203775 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms