Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
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Q3U6N9 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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