Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm14153-201ENSMUST00000119923 1139 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm42908-201ENSMUST00000197508 870 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Fxyd1-201ENSMUST00000039909 620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Scgb3a1-201ENSMUST00000043873 493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Scgb3a1-202ENSMUST00000076006 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm25483-201ENSMUST00000083224 227 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Cd14-201ENSMUST00000061829 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Lyrm1-204ENSMUST00000106518 875 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Snx10-202ENSMUST00000114439 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm15419-201ENSMUST00000148654 743 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Actb-207ENSMUST00000167721 1242 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Vmn2r-ps125-201ENSMUST00000176234 931 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Fam240a-201ENSMUST00000177678 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Rassf6-205ENSMUST00000202704 1178 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Zfp787-203ENSMUST00000207331 376 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms