Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
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Traf3ip1Q149C2 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Traf3ip1Q149C2 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Traf3ip1Q149C2 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Traf3ip1Q149C2 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
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Traf3ip1Q149C2 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Traf3ip1Q149C2 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Traf3ip1Q149C2 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Traf3ip1Q149C2 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Traf3ip1Q149C2 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Traf3ip1Q149C2 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Traf3ip1Q149C2 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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