Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Lrrc8dos-201ENSMUST00000135958 586 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gm16118-201ENSMUST00000161914 680 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gm5435-201ENSMUST00000179295 1150 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 1700052H01Rik-201ENSMUST00000196142 717 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 n-R5s5-201ENSMUST00000083134 119 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gdnf-201ENSMUST00000022744 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Pdgfd-202ENSMUST00000168039 1795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 AC154575.1-201ENSMUST00000227166 1474 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Aqp8-202ENSMUST00000098056 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Pla2g2d-201ENSMUST00000030528 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Ighv1-72-201ENSMUST00000103541 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gm38153-201ENSMUST00000195484 472 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gm2981-201ENSMUST00000213947 694 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Pcbd1-202ENSMUST00000218005 361 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Tmem63a-201ENSMUST00000027800 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gm11701-201ENSMUST00000121277 1142 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Rit1-207ENSMUST00000172252 820 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Ppp1r11-203ENSMUST00000174711 520 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Tac1-203ENSMUST00000184986 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gm17806-201ENSMUST00000195844 383 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 AC118476.4-201ENSMUST00000215385 790 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gm44629-201ENSMUST00000206951 1840 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Dgki-201ENSMUST00000042075 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Rab11fip3-201ENSMUST00000118828 3271 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Ccdc173-201ENSMUST00000094942 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Rbm4-201ENSMUST00000164209 801 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gm9553-201ENSMUST00000185703 996 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gm5696-201ENSMUST00000189850 552 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Tcstv3-202ENSMUST00000223967 779 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 AC124686.1-201ENSMUST00000225546 522 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Klk4-201ENSMUST00000007161 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Rsph14-203ENSMUST00000159994 1728 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gad1-201ENSMUST00000094934 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gm8848-201ENSMUST00000197270 1343 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Ighv1-9-201ENSMUST00000103498 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gm22009-201ENSMUST00000158792 343 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gm24352-201ENSMUST00000158966 125 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gm20529-201ENSMUST00000173683 203 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Cenpn-205ENSMUST00000212775 837 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Rpl21-ps2-201ENSMUST00000222933 481 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Olfr96-201ENSMUST00000078209 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Mef2a-204ENSMUST00000107476 4759 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Prdx1-204ENSMUST00000135573 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Scgb1b30-201ENSMUST00000108083 491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TrioQ0KL02 Gm22987-201ENSMUST00000122757 246 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms