Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Bpifb2-201ENSMUST00000028983 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Faap24-203ENSMUST00000154597 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm5191-201ENSMUST00000222882 1236 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 3110083C13Rik-202ENSMUST00000224786 907 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Olfr578-201ENSMUST00000056235 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm25483-201ENSMUST00000083224 227 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm25561-201ENSMUST00000104607 125 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Fgf1-203ENSMUST00000117566 418 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm8809-201ENSMUST00000119367 743 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm13799-201ENSMUST00000138883 838 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm21083-201ENSMUST00000188807 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm8960-201ENSMUST00000219787 788 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Tmem89-201ENSMUST00000026744 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Ribc1-201ENSMUST00000026288 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Adh1-201ENSMUST00000004232 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Fcgr3-204ENSMUST00000169017 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Spata7-202ENSMUST00000101144 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm24471-201ENSMUST00000104485 131 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm15602-201ENSMUST00000116162 465 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm12733-201ENSMUST00000119871 767 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm14153-201ENSMUST00000119923 1139 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm11608-202ENSMUST00000153049 877 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 1700019D03Rik-206ENSMUST00000190831 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm44204-201ENSMUST00000204722 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Rpl21-ps2-201ENSMUST00000222933 481 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 AC134439.3-201ENSMUST00000223486 851 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 AC163646.3-201ENSMUST00000228879 772 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Olfr1349-201ENSMUST00000051982 1054 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Mrps33-202ENSMUST00000114797 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Epp13-201ENSMUST00000121024 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm44805-201ENSMUST00000127648 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm16252-201ENSMUST00000144420 857 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm24352-201ENSMUST00000158966 125 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm7812-201ENSMUST00000203479 874 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm36172-201ENSMUST00000219852 723 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Uros-204ENSMUST00000106146 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms