Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pde1bQ01065 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms