Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Syne1-201ENSMUST00000041639 6990 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Rnf38-201ENSMUST00000045793 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Stx8-201ENSMUST00000021285 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Atp10d-202ENSMUST00000126664 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Abcc5-204ENSMUST00000115547 5372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PrcdQ00LT2 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms