Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx2P80206 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms