Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbdsP70122 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SbdsP70122 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Tcaf1-201ENSMUST00000045054 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Pms2-209ENSMUST00000148011 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SbdsP70122 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbdsP70122 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms