Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tra2bP62996 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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