Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmod1P49813 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms