Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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PtpreP49446 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
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PtpreP49446 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtpreP49446 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms