Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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