Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Rasgrp1-203ENSMUST00000172901 1903 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Chrne-202ENSMUST00000102556 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Pcgf5-202ENSMUST00000071267 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Tnni2-201ENSMUST00000105971 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Scgb1b30-201ENSMUST00000108083 491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Etfbkmt-202ENSMUST00000111547 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Rpl7a-ps13-201ENSMUST00000121692 563 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprmP28828 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprmP28828 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Aqp8-202ENSMUST00000098056 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Hmgn2-203ENSMUST00000102553 1265 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Gm11225-201ENSMUST00000118903 1049 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Gm14856-201ENSMUST00000121548 613 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Gm11827-201ENSMUST00000142297 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Cox6c-201ENSMUST00000014457 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Gm13855-201ENSMUST00000145644 744 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Gm29168-201ENSMUST00000189953 687 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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PtprmP28828 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PtprmP28828 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Fank1-202ENSMUST00000121560 475 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Gm7516-201ENSMUST00000186198 706 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Gm29388-201ENSMUST00000190718 284 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Gm37016-201ENSMUST00000195507 660 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Crip1-201ENSMUST00000006523 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PtprmP28828 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Ctse-201ENSMUST00000073350 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Mapk1ip1-202ENSMUST00000118810 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PtprmP28828 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Tspan2-202ENSMUST00000119902 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm14225-201ENSMUST00000142310 539 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 4933428C19Rik-201ENSMUST00000146043 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm15895-201ENSMUST00000157018 731 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm24352-201ENSMUST00000158966 125 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Gm35665-201ENSMUST00000206742 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 CT030657.4-201ENSMUST00000222177 744 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Scp2-ps2-201ENSMUST00000072166 478 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Olfr96-201ENSMUST00000078209 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Sav1-201ENSMUST00000021467 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprmP28828 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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