Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm17799-201ENSMUST00000183270 667 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm37009-201ENSMUST00000193297 361 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms