Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms