Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim30aP15533 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim30aP15533 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim30aP15533 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim30aP15533 Dnajc14-201ENSMUST00000026410 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim30aP15533 Aox2-201ENSMUST00000114366 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim30aP15533 Myt1l-205ENSMUST00000218583 4522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim30aP15533 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim30aP15533 Gm37798-201ENSMUST00000193026 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim30aP15533 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim30aP15533 Shcbp1-201ENSMUST00000022945 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim30aP15533 Heatr5b-201ENSMUST00000097281 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim30aP15533 Gmeb2-201ENSMUST00000049032 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Pde4d-209ENSMUST00000122041 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Ddo-201ENSMUST00000019977 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Synj2-207ENSMUST00000115788 3498 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Slc22a21-201ENSMUST00000076493 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Lsm6-203ENSMUST00000130325 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Ap3m1-206ENSMUST00000154460 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Col10a1-201ENSMUST00000105511 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Xdh-201ENSMUST00000024866 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Prpf40a-201ENSMUST00000076313 7374 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm9979-201ENSMUST00000069457 3005 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm12059-201ENSMUST00000128996 3105 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Scfd2-208ENSMUST00000151474 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 AI463170-201ENSMUST00000217839 970 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 BC005624-201ENSMUST00000028205 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Tec-201ENSMUST00000071944 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Egf-201ENSMUST00000029653 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Zfp709-203ENSMUST00000188685 7186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm12830-201ENSMUST00000137570 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Adgrl2-217ENSMUST00000200154 5412 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Pwp1-201ENSMUST00000001836 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Nedd4l-211ENSMUST00000226058 3393 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Baiap3-201ENSMUST00000169109 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Olfr126-203ENSMUST00000217487 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Rnf13-201ENSMUST00000041826 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm35394-201ENSMUST00000196434 3252 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Acbd5-212ENSMUST00000227663 4566 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm45139-201ENSMUST00000206543 2057 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Olfr15-203ENSMUST00000214590 6240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Ppfibp1-202ENSMUST00000111623 4782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Rimbp2-207ENSMUST00000200470 4083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Fbxw11-202ENSMUST00000093205 3938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Pik3c3-203ENSMUST00000115812 3257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Trp63-203ENSMUST00000115304 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Phf21a-208ENSMUST00000111294 3710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Sept6-202ENSMUST00000060474 3457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Rsrc1-201ENSMUST00000046542 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Slc23a1-201ENSMUST00000025212 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm12381-201ENSMUST00000126314 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Serpinb9c-201ENSMUST00000021837 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Rfx6-202ENSMUST00000122922 3464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Tmem108-201ENSMUST00000049452 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Vmn1r181-205ENSMUST00000228399 4616 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Myo15-201ENSMUST00000071880 11769 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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