Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm19428-202ENSMUST00000220573 1038 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm3379-201ENSMUST00000222259 642 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 3110083C13Rik-202ENSMUST00000224786 907 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 4933427E13Rik-201ENSMUST00000044347 381 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Tnfaip6-201ENSMUST00000065927 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm15720-201ENSMUST00000117133 282 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Naa38-204ENSMUST00000144531 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 4930403D09Rik-201ENSMUST00000147359 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 A330074H02Rik-201ENSMUST00000194667 1039 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm44658-201ENSMUST00000207965 637 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 AC099612.2-201ENSMUST00000226824 721 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Olfr1101-201ENSMUST00000099870 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm29601-201ENSMUST00000187961 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms