Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
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Ccl20O89093 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
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Ccl20O89093 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
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Ccl20O89093 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
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Ccl20O89093 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
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Ccl20O89093 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
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Ccl20O89093 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
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Ccl20O89093 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
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Ccl20O89093 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
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