Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Cep170-212ENSMUST00000194727 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Osbpl5-202ENSMUST00000119499 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Cd300a-201ENSMUST00000045151 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Naip1-201ENSMUST00000022142 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Wdfy3-205ENSMUST00000174598 10581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Zfp473-207ENSMUST00000149011 9230 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Jarid2-210ENSMUST00000173704 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Zfp229-201ENSMUST00000065871 4525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Tmco4-201ENSMUST00000043042 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Ralgps2-202ENSMUST00000063199 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Atcay-201ENSMUST00000047408 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Utp14b-202ENSMUST00000151622 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Tbc1d14-203ENSMUST00000126077 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Napb-201ENSMUST00000028926 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Sfi1-203ENSMUST00000101655 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Pcm1-201ENSMUST00000045218 6624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Tcaf2-201ENSMUST00000031879 4497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Tia1-202ENSMUST00000095753 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Zmpste24-201ENSMUST00000058754 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Rc3h1-202ENSMUST00000161609 11006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Sfta2E9PXB6 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms