Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Gm28065-201ENSMUST00000185290 833 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Ucma-205ENSMUST00000195688 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 AC122356.2-201ENSMUST00000226962 820 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Cox4i2-202ENSMUST00000109821 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm11307-201ENSMUST00000121088 929 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Ccdc28a-205ENSMUST00000174592 882 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 AC156561.1-201ENSMUST00000224774 233 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm5310-201ENSMUST00000197861 1511 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 4930470P17Rik-201ENSMUST00000062355 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm17644-201ENSMUST00000181272 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Vpreb3-202ENSMUST00000121151 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm29388-201ENSMUST00000190718 284 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Hbq1a-201ENSMUST00000020535 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 6430531B16Rik-205ENSMUST00000210254 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm34105-201ENSMUST00000214812 571 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm5397-201ENSMUST00000121081 1453 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Ighv2-5-201ENSMUST00000103449 347 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm14239-201ENSMUST00000116491 685 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm11401-201ENSMUST00000117212 344 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm9825-201ENSMUST00000178598 843 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm2324-201ENSMUST00000187464 662 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Ighv1-33-201ENSMUST00000193220 350 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm43110-201ENSMUST00000198877 226 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Flt3l-210ENSMUST00000211246 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm19045-201ENSMUST00000222488 1193 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Tff3-201ENSMUST00000024827 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Cst13-201ENSMUST00000046589 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm6960-201ENSMUST00000051629 639 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm6684-201ENSMUST00000053717 685 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Asb5-201ENSMUST00000033918 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Lypd4-201ENSMUST00000079306 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Etfbkmt-202ENSMUST00000111547 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm14654-201ENSMUST00000118620 447 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gstm1-202ENSMUST00000126593 828 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm13855-201ENSMUST00000145644 744 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Gm37218-201ENSMUST00000192917 390 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 AC157931.1-201ENSMUST00000198565 346 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Olfr170-203ENSMUST00000218837 1008 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 AC124173.1-201ENSMUST00000223701 189 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Clpsl2-201ENSMUST00000025061 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Olfr170-201ENSMUST00000078603 1008 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Tcl1-201ENSMUST00000041316 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NhsB1AV60 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms