Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Speer3W4VSP1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Speer3W4VSP1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Speer3W4VSP1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Speer3W4VSP1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Speer3W4VSP1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Speer3W4VSP1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Speer3W4VSP1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Speer3W4VSP1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Speer3W4VSP1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Speer3W4VSP1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Speer3W4VSP1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Speer3W4VSP1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Speer3W4VSP1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Speer3W4VSP1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Speer3W4VSP1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Speer3W4VSP1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Speer3W4VSP1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Speer3W4VSP1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Speer3W4VSP1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Speer3W4VSP1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms