Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm3550W4VSN7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms