Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z309

Cib2, Calcium and integrin-binding family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib2Q9Z309 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cib2Q9Z309 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cib2Q9Z309 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cib2Q9Z309 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cib2Q9Z309 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms