Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CcniQ9Z2V9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CcniQ9Z2V9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CcniQ9Z2V9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CcniQ9Z2V9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CcniQ9Z2V9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CcniQ9Z2V9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CcniQ9Z2V9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CcniQ9Z2V9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CcniQ9Z2V9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CcniQ9Z2V9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CcniQ9Z2V9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CcniQ9Z2V9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CcniQ9Z2V9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CcniQ9Z2V9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CcniQ9Z2V9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CcniQ9Z2V9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CcniQ9Z2V9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms