Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hdac6Q9Z2V5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms