Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mbd1Q9Z2E2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms