Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Mbd3Q9Z2D8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mbd3Q9Z2D8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mbd3Q9Z2D8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms