Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn8Q9Z260 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms