Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RfxankQ9Z205 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms