Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VarsQ9Z1Q9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VarsQ9Z1Q9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VarsQ9Z1Q9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VarsQ9Z1Q9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VarsQ9Z1Q9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VarsQ9Z1Q9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VarsQ9Z1Q9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VarsQ9Z1Q9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VarsQ9Z1Q9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VarsQ9Z1Q9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VarsQ9Z1Q9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VarsQ9Z1Q9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VarsQ9Z1Q9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VarsQ9Z1Q9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VarsQ9Z1Q9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VarsQ9Z1Q9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VarsQ9Z1Q9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VarsQ9Z1Q9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VarsQ9Z1Q9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VarsQ9Z1Q9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VarsQ9Z1Q9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VarsQ9Z1Q9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VarsQ9Z1Q9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VarsQ9Z1Q9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms