Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp4Q9Z1N6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sfrp4Q9Z1N6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms