Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hmg20bQ9Z104 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 216.3 ms