Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Skp2Q9Z0Z3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skp2Q9Z0Z3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms